알 수 없는 섬에서 깨어난 걸리버는 자신이 "릴리풋" 왕국의 엄지손가락만한 난쟁이들에게 잡혀있음을 알게 된다. 그들의 신임을 얻은 걸리버는 거대한 몸지을 이용해 왕국을 돕고, 그러다 릴리풋 옹국이 이웃 나라인 "라 푸스코"와 전쟁을 하게 될 것이란 사실을 알게 된다. 그러나 그가 릴리풋 왕국의 왕자 "페스토"에게 사랑하는 "마리나" 공주를 만나게 해준다고 약속하면서 적국의 스파이라는 누명을 쓰게 된다. 진정한 영웅심만이 이 소인국 간의 분쟁을 해결할 수 있는데....과연 걸리버는 성공할 수 있을까?